•   产品定义

            PSA（phenotype-segregation-analysis）即基于群体重测序的分离性状关联区域分析，对于性状分离的自然群体，非目标性状相关的SNP频率差异在自然群体间相互抵消，目标分离性状相关区域的分子标记频率会有差异，采用不同方法对标记的频率差异进行分布统计，从而对性状相关位点进行定位。

            不同于BSA混池测序分析方法，PSA不依赖于家系群体构建的必需条件，可以直接对自然群体的极端分离性状进行性状定位分析。

      文库 测序量
    二代测序

    350-500bp WGS文库

    单个个体 ≥ 30X

    测序方案

    参考基因组需求 测序个体数
    是

    极端性状1 ≥ 30个个体

    极端性状2 ≥ 30个个体

     

  • 采用FST、欧式距离（ED）、及显著差异allele个数三种方式联合分析，三种结果相互验证，从不同角度定位关联位点。

    图1 基于PSA方法的定位分析