实力验证丨国产纳米孔多物种实测“全面告捷”

 
 

近期,万摩科技依托国产纳米孔测序平台,已完成对哺乳动物、鱼类、禽类、蔬菜作物、果树林木、昆虫、虾蟹、微生物等十余个物种大类的实测,各类样本均获得高质量数据产出。这一成果充分验证了国产纳米孔测序技术在多种生物样本中的稳定性和通用性,为生命科学、农业育种、资源开发及基因组研究等领域提供了可靠且极具成本优势的技术支撑。

 

国产纳米孔测序实现超长读长与高准确率

长期以来,长读长测序高昂的成本让许多科研团队不得不缩减样本量、降低研究深度。齐碳O2体系通过新型纳米孔蛋白设计、全新控速蛋白研发及新型聚合物膜材料应用,在人类标准样本的官方验证中,单次测序准确率突破99%(达Q20标准),一致性准确率高达Q50(点击查阅详情)。万摩科技依托齐碳QPinnacle2高通量纳米孔测序平台及全新O2体系,自研面向多样化复杂场景的超长提取建库实验流程,成功打破了这一技术壁垒。目前,万摩科技实测样本RawData N50最高可达107kb以上(真核非人源样本)。

 

多物种实测数据见证国产平台硬核表现

自推出“3999元/20G超长纳米孔测序”以及“Nanopore-only T2T 基因组”等基于齐碳国产纳米孔平台的服务以来,我们收获了众多客户的信赖与支持,目前已完成涵盖生命科学、农业育种等领域绝大多数常见物种类型的项目实践。为全面展示平台在复杂基因组样本中的实测表现,本次从上述物种中分别选取代表性样本的超长测序(ultra-long)数据产出情况进行呈现,样本超长Reads的测序准确度指标(Mean Q)均值达到18.5,充分印证了齐碳纳米孔测序平台在多类型样本中稳定产出高质量超长读长数据的能力。

表1 部分样本实测数据展示

图1 部分样本Q值分布图

 

为验证齐碳纳米孔数据在基因组组装方面的应用能力,此前我们已完成了杨梅完美T2T基因组组装(点击查阅详情)鲫鱼完美T2T基因组组装(点击查阅详情),三代数据均仅使用齐碳Nanopore数据,全部染色体均达到0 gap,且所有端粒结构得到完整鉴定。这一成果充分证明了齐碳纳米孔平台的高质量与可靠性。目前,我们已积累多批次不同物种的Nanopore-only初步组装结果,现从其中选取部分可公开的组装数据予以展示,以供大家直观评估齐碳数据在基因组组装方面的实际表现。

表2 部分样本组装数据展示

 
 
 
 

此次大规模跨物种实测的出色表现,有力印证了齐碳纳米孔测序平台在多类型样本中卓越的适配能力与数据可靠性。万摩科技“3999元/20G超长纳米孔测序”、“Nanopore-only T2T基因组”、“细菌完成图”和“真菌基因组2+3”等产品现已全面开放服务,欢迎咨询合作,我们将竭诚为您提供优质测序解决方案!

 

3999元/20G超长纳米孔测序

  • 产品内容:超长DNA提取+建库+测序

  • 承诺标准:20Gb Pass Reads(N50≥100Kb)

  • 数据交付:全部产出Pass Reads(含上述20Gb超长数据)

注:承诺范围内物种,若达不到标准,免费!

 

 

Nanopore-only T2T基因组

从样本到Gap-free T2T基因组(含注释)

一价全包!

  • ≤400Mb基因组——19999元

  • 400Mb~1Gb基因组——23888元

测序方案:齐碳Nanopore+二代WGS(100x)+Hi-C(100x)+二代转录组测序(6G)

注:限二倍体

以上价格适用物种:常见哺乳动物(羊、兔除外)、常规瓜果蔬菜、常规粮油作物、大部分淡水鱼类、大部分果树林木等。

 

 

细菌完成图——600元/套起

  • 产品内容:细菌样本提取+建库+测序+组装+注释

  • 测序方案:齐碳Nanopore(1G) + 二代WGS(1G)

  • 高质组装:常规细菌样本可实现0 Gap完成图

  • 深度注释:提供CARD、VFDB、PHI等特有数据库注释,基因岛、前噬菌体、BGCs等功能元件预测

 

 

真菌基因组2+3——5000元/套

  • 产品内容:真菌样本提取+建库+测序+组装+注释

  • 测序方案:齐碳Nanopore(50Kb文库,5G) + 二代WGS(5G) + 二代转录组(6G)

  • 产品特色:50Kb纳米孔文库,组装连续性更佳;针对真菌基因组,提供DFVF、PHI等特有数据库注释,次级代谢产物生物合成基因簇预测等

注:适用于80Mb以内的真菌基因组

 

 

三代重测序及SV分析

价格:敬请期待!

  • 产品内容:提取+建库+测序+分析(三代SV鉴定+二代paragraph分型+相关下游分析)

  • 测序方案:齐碳Nanopore常规文库(N50:20Kb)测序,推荐≥20×/样

  • 产品特色:自主可控、成本更优,依托三代长读长优势实现SV更精准、更全面鉴定,突破复杂与罕见结构变异的检测局限

 

 

纳米孔全长转录组

价格:敬请期待!

  • 产品内容:提取+建库+测序+分析(全长序列鉴定+新转录本鉴定+可变剪接+转录本融合+APA分析+表达定量+差异表达分析)

  • 测序方案:齐碳Nanopore全长转录组6G

  • 产品特色:自主可控、准确可靠、成本更优,实现全长转录本结构解析与基因—转录本双层定量,让多样本研究不再受预算限制

其他物种样本方案欢迎咨询!

 

 

关于万摩科技

武汉万摩科技有限公司(下称“万摩科技”)是一家以多组学数据分析为技术核心且致力于基因科技应用转化的公司。基于二、三代基因测序,万摩科技致力于为科研院校、研究机构、测序公司、农业生产及育种公司提供数据分析、软件研发和平台开发服务,并重点专注于基因科技在农业育种方向的应用。

万摩科技亦致力于成为一家数据公司。基于对大语言模型、跨模态及智能体的研究,万摩科技深入探索AI在基因科学领域的应用场景,聚焦于成为这一产业发展过程中的引领者,推动多组学数据多频次多维度的解析,促进组学技术的深入应用。

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